Echipamente
DNA MICROARRAY
Ansamblu de echipamente ce cuprinde Agilent DNA SureScan Microarray scanner (achiziționat prin proiectul POSCCE 2.2.1 633/2014), Agilent Bioanalyzer, Echipamente suport (cuptor de hibridizare, vortex, minicentrifugi pentru chipuri), computere şi programe specializate destinate desfăşurarii experimentelor, extracţiei şi analizei datelor).
Echipamentul de scanare de înaltă rezoluţie pentru lame microarray, cu sensibilitate mare de detecţie şi sistem de autofocalizare dinamică, permite scanarea lamelor microarray cu densitate înaltă a sondelor oligonucleotidice
Aplicaţii:hibridizare comparativă genomică bazată pe microarray – array-CGH – pentru analiza dezechilibrelor genomice şi CGH+SNP pentru identificarea simultană a variaţiilor numărului de copii ADN şi a regiunilor de pierdere a heterozigoţie.
SECVENŢIERE
Echipamentul pentru secvenţiere Sanger situat în Laboratorul de Genetică Medicală, Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer (achiziționat prin proiectul POSCCE 2.2.1 633/2014), este o platformă integrată care combină un hardware performant, analizorul cu 8 capilare, şi programe dedicate pentru secvenţierea directă şi analiza de fragmente.
În plus, echipa noastră utilizează și platforma de secvențiere țintită de nouă generaţie – Ion PGM System (ThermoFisher Scientific) situată în Laboratorul de Patologie Moleculară, Departamentul Anatomie Patologică.
Aplicaţii:secvenţiere ţintită ADN, analiză de fragmente prin electroforeză capilară, MLPA
GENETICĂ MOLECULARĂ
Echipamente PCR (Corbett Real Time PCR – Rotor Gene6000, Corbett Palm Cycler) și echipamente generale genetică moleculară.
Aplicaţii: tehnologii bazate pe PCR
MICROSCOPIE OPTICĂ PENTRU APLICAŢII CITOGENETICE
Microscop motorizat Axio Z1 Zeiss cu examinare în lumină transmisă direct şi epifluorescenţă, echipat cu dispozitiv CCD monocrom, de înaltă rezoluţie; microscop Nikon E800 cu examinare în lumină transmisă direct şi epifluorescenţă, echipat cu dispozitiv CCD monocrom, de înaltă rezoluţie.
Pachet software Metasystems pentru scanare, detecţie şi captare automată a imaginilor pentru citogenetică (programele Metafer şi Ikaros), cariotipare (programul Ikaros) şi hibridizare in situ fluorescentă (programele M-FISH, m-BAND, Q- FISH şi CGH).
Aplicaţii: teste de citogenetică clasică şi moleculară